1、开机前的准备：打开氮气、氧气瓶，并调分压表压力为0.6MPa，接通总电源。
2、打开氢气发生器电源开关
3、检查各气路是否漏气。
4、开启主机与工作站，并使两者通讯。
4.1、确定各种抽需气体（N2、H2、Air）打开HP6890开关后，打开PC机开关进入“Windows”，在“HP ChemStations”里选择“HP ChemStations”，打开“Configure”里选择“Instrument”。
4.2、选择“6890GC”，点“OK”，则需选择主机的HPIB卡的地址，按主机键盘上的“Options”键，选“Communication”，科查到HP6890的HPIB卡的地址，输入工作站。
4.3、再选择工作站的HPIB卡的地址：同上方法，打“Configure”选择“HPIBCard”，给出本机的HOIB卡地址。
4.4、做好上述工作后，打开“File”，保存上述Configure。推出此画面。
4.5、在“PH Chemstations”里选择“Instrument I-Online”进入工作站，并可使HP6890与其工作站成功通讯。
5、编辑整个方法
5.1、从“View”里选择“Method and Run Control”画面，点击“Show Toptoolbar”、“Show Side Toolbar”、“Command line”，并从“Oline signal”处选择“Signal Window 1”。
5.2、打开“Method”菜单，单击“Edit Entiremethod”，进入方法编辑。
5.3、写出方法的信息，编辑进样种类及位置。
5.4进入整个参数设定。a)进样口参数的设定；b）色谱柱参数的设置；c）炉温的设定；d）检测器参数的设置；e）输出信号的设置；f）以上参数编辑好后，单击“OK”。
5.5、编好仪器参数后，即会进入到积分参数设定的画面，积分参数可先不做修改，单击“OK”，即进入报告的设定，选择好报告按“OK”。
5.6、打开“Method”菜单，保存方法：“Save as Info”，给一个新的文件名。
6、做样品分析
6.1在菜单中打开“Run Control”，选择“Sample Info”，将会进入填写样品信息表，填好后单击“OK”，再从此菜单中选择“Run Method”，运行方法。
6.2、从进样口注入样品，同时按主机键盘上的“Start”键进行样品分析。
6.3、填写或打印出分析原始记录。
7、实验结束后，推出化学工作站，推出Windows，关闭PC机，把主机键盘上将各个部件，位置降温，关闭FID支持气体，待各处温度全降下来后，关掉气相色谱仪电源，最后关掉气源，关闭总电源。
8、检查好后，填写仪器使用记录，清理检测完毕的样品后周围的环境。