一．快速
     仪器分析法的样品处理一般都比化学分析法简单，从而大大地提高了分析速度。例如冶金部门采用直读光谱法进行炉前分析时，在数分钟内可同时得出钢样中二、三十个元素的分析结果。另外由于在仪器分析法中普遍采用了先进的电子技术和计算机技术，从而大大地提高了仪器操作的自动化程度（自动进样、记录、打印、停机）和数据处理的速度。
二．灵敏
     化学分析法通常适于常量分析，而仪器分析法中除示差光度分析、电容量分析、电重量分析以及X射线荧光分析等主要用于常量分析外，多数仪器分析方法适于微量、痕量分析。例如试样中含有ppm铁，用0.01NK2Cr2O7标准溶液滴定时，所消耗的标准液体积只有0.02Ml (半滴)，已知滴定管的滴定误差为0.02mL，这就无法用于容量分析测定此液中微量铁。但是用邻菲罗淋为显色剂很方便地对微量铁进行比色测定。因此最普通的比色法的相对灵敏度可达到ppm级（10-4%），原子吸收法、原子荧光法、气相色谱法、质谱法等分析方法可测ppb（10-7%），甚至可测ppt级（10-9-9%）的痕量物质。激光光谱汉、菲火焰原子吸收法和电子探针法等绝对灵敏度可达10-12 g以下。
三．多元素、无损分析
     一些仪器分析可同时进行多元素分析，例如原子发射光谱分析可同时对一个试样中几十个元素的分析。又如术谱分析可在同一个溶液中连续测定Cu、Cd、Ni、Zn、Mn等离子。一些仪器分析法的度样用很少，例如红外光谱法的试样需数毫克，而质谱法的试样只需10-12g，尤其激光光谱法、电子探针法、离子探针法和电子显微镜法等可以进行表面、微区、无损分析。
四．相对误差较大
     化学分析法的相对误差一般都可以控制在0.2%以内，有些仪器分析法，如示差光度法、电重量法、库仑滴定法等也可以达到化学分析的准确度，但多数仪器分析的相对误差较大，一般在±1%~5%，有时甚至大于±105，但对微量、痕量分析来说，还是基本上符合要求的。例如Zn中含杂质 Cu20ppm，假设用比色法测定时的相对误差为±10%，则测得Cu的含量为18~22ppm，与实际含量只差±2ppm，即为百分之二，这样的分析结果一般认为是符合要求的。但是进行常量分析时，例如测定精矿中含Cu为20%时，仍采用比色法测定，设其相对误差仍为±，则渑得Cu的含量为18~22%，则与实际含量相关±2%之多，如以含Cu量20%为其一等级，这时就难以确定该Cu精矿的品位。因此，多数仪器分析方法由于其相对误差较大而不适于常量分析。
五．仪器设备大型复杂不易普及
     目前多数分析仪器及其附属设备都比较精密贵重，不少分析仪器都带有微处理机，尤其一些联用机，例如色质谱仪是由色谱仪和质谱仪两种大型分析仪器连接使用，离子探针分析仪是由等离子体发生器和质谱仪连接使用，电子探针分析仪是由电子显微镜和X射线光谱仪连接使用等等。这些大型复杂精密仪器，每台需几十万元，而且目前有不少仪器需用外汇从国外引进。各种分析仪器通常都需配备专业人员进行操作维护和管理等等。因此有些大型分析仪器目前尚不能普及应用。
六．仪器分析法必须与化学分析法配合使用
     多数仪器分析法需用化学纯品作标样，而化学纯品的成分多半要用化学分析法来确定。多数仪器分析方法中的样品处理（溶样、干扰分离、试液配制等）需用化学分析法中常用的基本操作技术。在建立新的仪器分析方法时，往往需用化学分析法来验证。尤其对一些复杂物质分析时，常常需用仪器分析法和化学分析法进行综合分析，例如主含量用化学分析法、微量杂质用仪器分析法测定。因此，化学分析法和仪器分析法是相辅相成的，在使用时可根据具体情况，取长补短，互相配合。